Namugongo ist zu einem Wallfahrtsort für Menschen aus Uganda und den Nachbarländern Kenia, Ruanda, Tansania, Burundi und Kongo geworden. Die Pilgerreise beginnt am 25. Mai und dauert bis zum 2. Juni. Der 3. Juni ist der Höhepunkt, ein offizieller freier Tag.
Märtyrer - Konvertiten zum Anglikanismus (23) und Katholizismus (22) wurden zwischen 1885 und 1887 hingerichtet. Die Hinrichtungen fanden während der Herrschaft von Kabaka Mwanga II, König von Buganda, statt. Die meisten Hinrichtungen fanden 1886 in Namugongo statt.
Am Märtyrertag werden Messen mit liturgischen Tänzen abgehalten. Minister, Vertreter von Botschaften und anderen Nationen nehmen an den Veranstaltungen teil.
